$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
1. الانشطار الخميرة الثقافة
- تعد وسائل الإعلام الحد الأدنى ادنبره (EMM) وبدون EMM ammoniumchloride (EMM - N) 8. للحد من تألق ذاتي ينبغي أن الحل لا يكون الغلوكوز تعقيمها ولكن بدلا من ذلك تصفية تعقيمها باستخدام ميكرومتر 0.2 تصفية وأضاف في وقت لاحق الى وسائل الاعلام تعقيمها.
- تلقيح خلايا الخميرة الانشطار نمت حديثا على صفيحة آغار مع الوسائط الغنية ، والموافقة 8 ، في 3 مل من وسائل الاعلام مع الجلوكوز السائل EMM تعقيمها التصفية. استخدام أنابيب 13mL مع دفع برفق على الغطاء لضمان التهوية الجيدة للخلايا. السماح للخلايا تنمو بنسبة تهتز لهم 225 دورة في الدقيقة في 30 درجة مئوية. يتبع لمدة 2 يوم بواسطة عد لها باستخدام غرفة Burker بواسطة التخفيف المناسبة ، كل صباح ومساء -- إبقاء الخلايا في مرحلة النمو السجل (2 X 10 7 خلية / مل 1 10 X 6).
- في يوم من التجربة تأكد من أن الخلايا في مرحلة مبكرة سجل (5) ، X 06-01 أكتوبر X 10 7 خلية / مل.
- لتجويع رانه لخلايا النيتروجين خلال التبديل 20 دقيقة من وسائل الاعلام لEMM EMM - N وسائل الإعلام. قد يتم ذلك عن طريق حصاد 3 مل من الخلايا في أنبوب 1.5 مل إيبندورف في اجهزة الطرد المركزي مقاعد البدلاء في أعلى إطار التعاون الإقليمي والحد الأقصى 1.5 الطرد المركزي بسرعة أكبر لحث على الاستجابة للضغط النفسي في الخميرة الانشطار 9. استخدام تقنية مزدوجة الغزل ، وهذا يعني ، تدور الأولى لل2 دقيقة ، ثم أعد تشغيل أنبوب إيبندورف 180 درجة وتدور مرة أخرى لمدة 1.5 دقيقة 2 RCF 10. هذا يساعد على جمع كافة الخلايا في واحدة بيليه في الجزء السفلي من الأنبوب. يغسل مرة واحدة مع EMM - N وتذوب ثم بيليه في EMM - N واحتضان الخلايا لمدة 15 دقيقة عند 30 درجة مئوية في 225 دورة في الدقيقة تهتز ثم تابع إلى نقطة 2. نموذج التحضير.
2. إعداد نموذج
- قد الحصاد 1.5 مل من الخلايا في أنبوب 1.5 مل إيبندورف في اجهزة الطرد المركزي مقاعد البدلاء في أعلى إطار التعاون الإقليمي والحد الأقصى 1.5 الطرد المركزي بسرعة أكبر لحث على الاستجابة للضغط النفسي في الخميرة الانشطار 9. استخدام تقنية مزدوجة الغزل وميانينانوغرام ، الأولى تدور لمدة 2 دقيقة ، ثم أعد تشغيل أنبوب إيبندورف 180 درجة وتدور مرة أخرى لمدة 2 1.5 RCF 10 دقيقة. هذا يساعد على جمع كافة الخلايا في واحدة بيليه في الجزء السفلي من الأنبوب.
- إزالة طاف ، ولكن ترك 10-15 ميكروليتر وresuspend الخلايا المتبقية في وسائل الإعلام. بدلا من إضافة 10 ميكرولتر من وسائل الإعلام الجديدة لresuspend الكرية الخلية.
- تأكد من أن الشرائح الزجاجية واضحة والغطاء الزجاجي (لا 1.5). عادة لم يكن لديك لتنظيفها ، ولكن تأكد من أنها ليست مليئة بالغبار.
- أخرج من الفريزر an قسامة حل سهم lectin 1mg/mL التي تم تعقيمها التصفية. يمكن أن يكون الحل lectin refrozen بضع مرات. يستخدم lectin لإصلاح خلايا الخميرة في كوب الغطاء.
- 5 ميكرولتر من مكان EMM مع الجلوكوز تعقيم تصفية على زجاج الهدف.
- مكان 5 ميكرولتر من محلول lectin في زاوية من الزجاج غطاء. المكان في وقت لاحق 5 ميكرولتر الثقافة الخلية في الزاوية نفسها ، أي في إسقاط lectin. انتشار المزيج بواسطة pipetting بضع مرات ثم الخلية الثقافة lectin مزيج من الزجاج تغطي جميع أنحاء باستخدام الجانب طويلة من غيض ماصة. اعتمادا على كثافة الخليط صومعتك ترك كل شيء أو تمتص السيولة الفائضة في الزاوية المقابلة من الزجاج غطاء.
- وضع غطاء من الزجاج ، حتى أعلى ، مع جانب واحد على زجاج موضوعية وعلى الجانب الآخر على مقاعد البدلاء. السماح لتغطية الزجاج الجافة قليلا لبضع دقائق. بالتأكيد لا ينبغي أن تكون جافة تماما ، ولكن لا ينبغي أن يكون السائل كثيرا على الزجاج.
- وضع غطاء من الزجاج مع ملاكا التقريبية · 70 من الزجاج الهدف من قطرة من EMM. ترك غطاء من الزجاج بحيث تقع أعلى إلى أسفل في قطرة من EMM.
- وختم حواف مع الشحوم السيليكون تحضير حقنة 2 مل. قطع نهاية واسعة من طرف 200 ميكروليتر وإرفاقه المحقنة. ملء المحاقن مع حوالي 1 مل من الشحوم السيليكون. يتم تطبيق خيطا رفيعا من السيليكون على حواف الزجاج التي تغطي القيح بلطفهينج المكبس من المحاقن. الآن لديك غرفة صغيرة من النمو س. pombe الخلايا.
3. المجهري
- Initialise في مضان المجهري عن طريق تشغيل مصباح الزئبق / زينون ، المجهر والكمبيوتر. مكان الغرفة نمو الخميرة في مضان المجهر. استخدام هدفا X 63 X أو الهدف 100 مع NA = 1.3 أو أعلى. إذا كان يستخدم هدفا للنفط ، إضافة النفط.
- استخدام الحقل مشرق للعثور على الخلايا والحصول على صورة حادة.
- إعدادات المجهري مضان تختلف تبعا لfluorochromes تستخدم لتسمية خلايا الخميرة والمجهر. نستخدم مبائر مجهر زايس LSM مجهر المسح الضوئي ليزر 700 مع خطة لامزيغ - 63x النفط عدسة الهدف (NA = 1.4) مع خط المتوسط 16 طائرة إعداد المسح الضوئي. يجب تعيين وحدات ذات الثقب إلى 1-1،1 إيري ، الذي يعطي شريحة بصرية من 0.8 ملم. اكتشفنا GFP في المسار 1 باستخدام مجموعة تصفية اليكسا 488 مع التقسيم في شعاع 582 نانومتر ، وبذلك دetecting موجات بين 488 و 582 نانومتر. في المسار 2 نستخدم مجموعة التصفية المثلى لmCherry باستخدام الحزمة الخائن في 578 نانومتر ، وبالتالي الكشف عن الموجات بين 578 و 600 نانومتر. هذا يعني أنه في المسار 2 وسيتم الكشف عن كل من mRFP (SPB) ، وشمال البحر الأبيض المتوسط (mCherry).
- كما أخذ العديد من الصور اللازمة لتكون قادرة على قياس في 60 الخلايا مختلفة عن كل سلالة. عادة 15 صورة من حقول المجهري مستقلة بما فيه الكفاية. فمن المستحسن أن يتم تكوين غرفة جديدة للنمو مع خلايا جديدة اذا وقتك المجهري يتجاوز 60 دقيقة.
4. الكمية قياس المسافات التحت خلوية
- فتح الصور في برنامج زن زايس الطبعة الخفيفة. باستخدام أداة قياس المسافة في القياسات بين ميكرومتر fluorochromes مختلفة في كافة الخلايا فيه جميع الاشارات في طائرة الوصل نفسه. ضبط شدة الضوء والتباين في تحديد مركز للإشارة الفلورسنت. يستخدم هذا البروتوكول المبسط اثنين فقط ج مختلفةوبالتالي olours SPB وشمال البحر الأبيض المتوسط هي في نفس القناة. هو خص بها SPB هيكلها جولة كبيرة في شمال البحر الأبيض المتوسط. نقل المسافات إلى ورقة المفكرة. قياس لا يقل عن 60 في الخلايا. ويمكن أيضا برامج أخرى مثل ImageJ يمكن استخدامها لقياس المسافة ، ولكن يفضل زايس زن الخفيفة بسبب قرار العالي ، من الصورة وسهولة للتكبير والتصغير باستخدام هذا البرنامج. والصور في شكل LSM افتتح في ImageJ يكون القناتين على رأس كل منهما الآخر. لجعل صورة مع كل القنوات ، وتقسيم لأول مرة دمج القناتين وبعد ذلك لهم. بعد ذلك يمكن أن تستخدم أداة سطر لقياس المسافات على النحو الموصوف أعلاه.
- قارن بين المسافات يعني أو الوسيط بين سلالات مختلفة التحت خلوية والعلاجات باستخدام البرنامج الإحصائي ، على سبيل المثال اختبار t أو اختبار مان ويتني مجموع رتبة ، على سبيل المثال باستخدام برنامج SigmaStat - 3.5. في كثير من الأحيان ليست البيانات الموزعة منذ عادة سيكون هناك اختيار للخلايا مع أقصرالمسافات بين الإشارات الفلورسنت منذ إشارات جميعا بحاجة إلى أن يكون في الطائرة نفسها إلى التنسيق يقاس. يمكن فقط لاختبار t يتم استخدامها عند البيانات لديها التوزيع العادي في حين أن مجموع رتبة اختبار مان ويتني يسمح للمقارنة بين مجموعات البيانات التي تفتقر إلى التوزيع العادي. في اختبار T - تقارن يعني اثنين من قواعد البيانات المختلفة أثناء وجوده في رتبة مجموع اختبار مان ويتني تتم مقارنة المتوسط.
5. ممثل النتائج
سلالة PJ1185 : (ح + + his7 : dis1placR -- GFP Chr1 [: : + ura4 hphMX6 lacO] natMX6 ura4 - D18 leu1 - 32 - DN ade6 / N - sid4 mRFP : : : kanMX6 cut11 - mCherry :) كانت تزرع في EMM . تم سحب عينة والذي أقيم في غرفة صغيرة النمو ، وأخذت الصور (الشكل 1A + N). بعد ذلك تم استبدال وسائط النمو مع EMM ث / س ammoniumchloride (EMM - N) ، وكانت الخلايا زrown لمدة 15 دقيقة في حين تهتز. وقد شنت بعد ذلك تجويع الخلايا النيتروجين في غرفة النمو مع EMM - N والصور أخذت (الشكل 1A - N). تم استخدام أداة قياس لقياس المسافة بين موضع (GFP) وSPB في (الشكل 1B والجدول 1). بالإضافة إلى ذلك ، تم قياس المسافة بين موضع (GFP) وشمال البحر الأبيض المتوسط (1B الشكل والجدول 2). وتمت مقارنة المسافات التحت خلوية وسيطة قبل وبعد استنزاف النيتروجين باستخدام 3.5 SigmaStat البرمجيات (الجدول 3). كان هناك تحول كبير إحصائيا في توطين الكتلة الجين تتحرك بعيدا عن شمال البحر الأبيض المتوسط نحو SBP. كانت بيانات قياس المسافة بين GFP وSBP في التوزيع العادي ، وبالتالي يعني مسافات (1،777 ميكرومتر + N و1587 ميكرومتر - N) ويمكن مقارنة باستخدام اختبار t (الجدول رقم 1 و 3). كان هناك فرق كبير بين القيمتين يعني (P = 0.008 ، اختبار t). فإن البيانات قياس المسافة بين GFP وشمال البحر الأبيض المتوسط لم يكن لديك دي العاديوتمت مقارنة stribution وبالتالي المسافات المتوسطة (0 ميكرون + N و 0.390 ميكرون - N) باستخدام مبلغ رتبة اختبار مان ويتني (الجدول 2 و 3). كان هناك فرق كبير بين القيمتين وسيطة (P <0.001 ، المجموع رتبة مان ويتني الاختبار).

الشكل 1 ، وتوطين مجموعة من الجينات المسماة Chr1 ، التي تميزت GFP ، تغيرت بعد المجاعة النيتروجين. (أ) العمود الأيسر ، + N ، وهو ممثل نواة الخلية من خلية تزرع في العمود الأيمن EMM ، - N ، وهو ممثل نواة الخلية من خلية تزرع في EMM - N. الأخضر هو إشارة GFP العلامات الكتلة Chr1 ، الأحمر هو mRFP mCherry ووصفها SPB وشمال البحر الأبيض المتوسط ، على التوالي. (ب) نواة الخلية نفس (A) ولكن الآن مع قياس المسافات subnuclear ؛ الصفراء : قطر نواة الخلية ، الزرقاء : المسافة بين SPB وإشارة GFP والوردي : المسافة بين إشارة GFP والغشاء النووي.

الجدول 1 ، وقياس المسافات في subnuclear ميكرون من سلالة PJ1185 تزرع في EMM. أول صف ، وقطره من الخلية (د) ، الصف الثاني ، وبعد المسافة بين GFP وSPB ، والصف الثالث ، وبعد المسافة بين GFP وشمال البحر الأبيض المتوسط.



الجدول 2. قياس المسافات في subnuclear ميكرون من سلالة PJ1185 تزرع في EMM - N. أول صف ، وقطره من الخلية (د) ، الصف الثاني ، وبعد المسافة بين GFP وSPB ، والصف الثالث ، وبعد المسافة بين GFP وشمال البحر الأبيض المتوسط.
الجدول 3. الإحصاء الوصفي من المسافات التي لوحظت في subnuclear PJ1185 قبل سلالة (+ N) وبعد (- N) التجويع النيتروجين. الصف الأول : عدد الخلايا قياسه ، الصف الثاني : يعني القطر (د) من الصف الثالث : قطر وسيطة (د) من الصف الرابع : يعني المسافة بين GFP وSPB ، الصف الخامس : مسافات سيطة بين GFP وشمال البحر الأبيض المتوسط.